RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 TMCO5BA8MYB1 307 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 C9J4A7 227 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PEX12O00623 359 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 LDB2O43679 373 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 GPR89BP0CG08 455 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TSFMP43897 325 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 HCAR3P49019 387 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PLCL1Q15111 1095 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 STX1AQ16623 288 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF569Q5MCW4 686 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CDH24Q86UP0 819 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 GPR150Q8NGU9 434 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 IP6K3Q96PC2 410 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SPATA16Q9BXB7 569 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TLR10Q9BXR5 811 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TRIM7Q9C029 511 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ANO10Q9NW15 660 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SOHLH2Q9NX45 425 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 MYO6Q9UM54 1294 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PADI2Q9Y2J8 665 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD12Q6UB98 2062 aa13.5□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 RGSL1A5PLK6 1076 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PRPSAP2O60256 369 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 MTX2O75431 263 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 RNF8O76064 485 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PRLP01236 227 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CYP2A7P20853 494 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 MIPP30301 263 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SSTR2P30874 369 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CDH6P55285 790 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CDC16Q13042 620 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ALS2CLQ60I27 953 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PPM1MQ96MI6 270 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 LYSMD1Q96S90 227 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 FANCEQ9HB96 536 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 P4HTMQ9NXG6 502 aa13.49□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 OR5K3A6NET4 321 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM150CB9EJG8 249 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 JRKO75564 520 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 IGHEP01854 428 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ATP1A3P13637 1013 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 AMPD1P23109 780 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 HALP42357 657 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SOX8P57073 446 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 KCNK10P57789 538 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 DSC2Q02487 901 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SSPNQ14714 243 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 RPE65Q16518 533 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TMCO3Q6UWJ1 677 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 MRGPRGQ86SM5 289 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 MMP21Q8N119 569 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 OR1L3Q8NH93 324 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 DNAJB14Q8TBM8 379 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 GLYATL1Q969I3 302 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 GBP5Q96PP8 586 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZWILCHQ9H900 591 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 BTRCQ9Y297 605 aa13.48□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC53A6NM62 1247 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CDK14O94921 469 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 VCLP18206 1134 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CAPN3P20807 821 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 HADHAP40939 763 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 RPL26P61254 145 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 MLIPQ5VWP3 458 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 ARMC6Q6NXE6 501 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 TEX26Q8N6G2 289 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC120Q96HB5 630 aa13.47□□□□□ -0.25
ATG4B-222ENST00000491867 CNDP1Q96KN2 507 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms