RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 KCNK1O00180 336 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 DFFAO00273 331 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SCAMP1O15126 338 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MATN3O15232 486 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CCDC22O60826 627 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RFPL3O75679 317 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 DKK1O94907 266 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 HAUS5O94927 633 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 IGSF6O95976 241 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 GSRP00390 522 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ITGA2BP08514 1039 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 VSIG8P0DPA2 414 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 JUPP14923 745 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PAMP19021 973 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 DGKAP23743 735 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PTPN4P29074 926 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TYK2P29597 1187 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 GRIA1P42261 906 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MAGEA12P43365 314 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RGRP47804 291 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RXRGP48443 463 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ACADVLP49748 655 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NDST2P52849 883 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 LIMK2P53671 638 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SGCGQ13326 291 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SERINC3Q13530 473 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KRT72Q14CN4 511 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 HES3Q5TGS1 186 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TTC7BQ86TV6 843 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MPP5Q8N3R9 675 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CRELD1Q96HD1 420 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RBBP8Q99708 897 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NPHS2Q9NP85 383 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 LHX3Q9UBR4 397 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KLF15Q9UIH9 416 aa6.21□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 A0A0G2JND7 137 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 A8MX80 341 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MEN1O00255 615 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 YKT6O15498 198 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MAGEC1O60732 1142 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PIAS2O75928 621 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ATP6V1G2O95670 118 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 JCHAINP01591 159 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SERPINE1P05121 402 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NFKB1P19838 968 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 BGNP21810 368 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CALB2P22676 271 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CCND1P24385 295 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NUDT1P36639 197 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 HK2P52789 917 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 DAB2P98082 770 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 OCRLQ01968 901 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 VAC14Q08AM6 782 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ZBTB17Q13105 803 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 STX3Q13277 289 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MPP3Q13368 585 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 C1orf61Q13536 156 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 LAMB3Q13751 1172 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 BMPR2Q13873 1038 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 FZD2Q14332 565 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CHI3L2Q15782 390 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PCID2Q5JVF3 399 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 AFMIDQ63HM1 303 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NEK5Q6P3R8 708 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms