RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	PREP	P48147	710 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ARL4C	P56559	192 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	E2F1	Q01094	437 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC7A5	Q01650	507 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	DMPK	Q09013	629 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CLCA4	Q14CN2	919 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	BRD3	Q15059	726 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TRADD	Q15628	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	HIF1A	Q16665	826 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	DUPD1	Q68J44	220 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	PACS1	Q6VY07	963 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM135	Q86UB9	458 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	HM13	Q8TCT9	377 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	BPTF	Q12830	3046 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	MYLK	Q15746	1914 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095		A0A0G2JNG1	304 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	AGRP	O00253	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	B4GAT1	O43505	415 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	KCNJ13	O60928	360 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	VIP	P01282	170 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	FTH1	P02794	183 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	OR56A5	P0C7T3	313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CDK4	P11802	303 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC19A1	P41440	591 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ELK3	P41970	407 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	HAL	P42357	657 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	MAPK9	P45984	424 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	FASLG	P48023	281 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TTPA	P49638	278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SPIDR	Q14159	915 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CRYM	Q14894	314 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	KIR2DS5	Q14953	304 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	LONRF1	Q17RB8	773 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SYTL3	Q4VX76	610 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	KRT222	Q8N1A0	295 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC6-222	ENST00000478095	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8

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