RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 GRM2Q14416 872 aa6.34□□□□□ -1.39
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PRKCI-202ENST00000476635 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.34□□□□□ -1.39
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PRKCI-202ENST00000476635 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 OR7A17O14581 309 aa6.32□□□□□ -1.4
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