RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB16	A2A368	324 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PRR19	A6NJB7	356 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AGRP	O00253	132 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR1I1	O60431	355 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AP2A2	O94973	939 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CPNE6	O95741	557 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR56A5	P0C7T3	313 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SLC19A1	P41440	591 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TTPA	P49638	278 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CAMK2B	Q13554	666 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SEMA3A	Q14563	771 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NR1D2	Q14995	579 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CLCA4	Q14CN2	919 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PROSER1	Q86XN7	944 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR10G6	Q8NH81	332 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	HM13	Q8TCT9	377 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CHD6	Q8TD26	2715 aa		17.4	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902		F8W8V4	182 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	QSOX1	O00391	747 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NDUFS3	O75489	264 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	FTH1	P02794	183 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CD1C	P29017	333 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	INHBC	P55103	352 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CYP4F3	Q08477	520 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	KRT33B	Q14525	404 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PHF19	Q5T6S3	580 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PACS1	Q6VY07	963 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	HOOK3	Q86VS8	718 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NXPE2	Q96DL1	559 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SNF8	Q96H20	258 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SGSM3	Q96HU1	749 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	C12orf66	Q96MD2	445 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMEM74	Q96NL1	305 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	STRADB	Q9C0K7	418 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	17.39	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DUX1	O43812	170 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MPO	P05164	745 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ITGB6	P18564	788 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	IVD	P26440	423 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	GPLD1	P80108	840 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MORF4L2	Q15014	288 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	BRD3	Q15059	726 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	RPE65	Q16518	533 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	BBS9	Q3SYG4	887 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ARMC3	Q5W041	872 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MDM1	Q8TC05	714 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NCSTN	Q92542	709 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	ELMO1	Q92556	727 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	COG4	Q9H9E3	785 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	POT1	Q9NUX5	634 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	DKK4	Q9UBT3	224 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	SNX24	Q9Y343	169 aa		17.38	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	PFDN6	O15212	129 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	TYRP1	P17643	537 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	AMD1	P17707	334 aa		17.37	■□□□□ 0.37
USP19-210	ENST00000465902	MPST	P25325	297 aa		17.37	■□□□□ 0.37

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