RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	INPPL1	O15357	1258 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	VEGFD	O43915	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CREG1	O75629	220 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	MOCS3	O95396	460 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PLAU	P00749	431 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	MMP3	P08254	477 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ITIH1	P19827	911 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	MYF6	P23409	242 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	KCNJ1	P48048	391 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	NME5	P56597	212 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	UBASH3A	P57075	661 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	FHL1	Q13642	323 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PKP1	Q13835	747 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TWIST1	Q15672	202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ACE	P12821	1306 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	RHOD	O00212	210 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBTB43	O43298	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	RNF8	O76064	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	RGS11	O94810	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	REC8	O95072	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	HEXB	P07686	556 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	GNAZ	P19086	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CD58	P19256	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CTNNB1	P35222	781 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PLCD1	P51178	756 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TKTL1	P51854	596 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CASP9	P55211	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	UGCG	Q16739	394 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CDO1	Q16878	200 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNOT10-208	ENST00000463006	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms