RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	AGAP14	A8MT82	685 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970		A8MU76	341 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970		F8W8V4	182 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	DUX1	O43812	170 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	KCNJ13	O60928	360 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	BANF1	O75531	89 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TCEA3	O75764	348 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CPNE6	O95741	557 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	FTH1	P02794	183 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PROS1	P07225	676 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	OR56A5	P0C7T3	313 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	BRAF	P15056	766 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PNLIP	P16233	465 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TYRP1	P17643	537 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	AMD1	P17707	334 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PAM	P19021	973 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CD1C	P29017	333 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC19A1	P41440	591 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	NSG1	P42857	185 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR3	P46089	330 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PREP	P48147	710 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	GABRE	P78334	506 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ACVR1	Q04771	509 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SEMA3A	Q14563	771 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ITIH4	Q14624	930 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CLCA4	Q14CN2	919 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PLCL1	Q15111	1095 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	RPE65	Q16518	533 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	BBS9	Q3SYG4	887 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PCGF5	Q86SE9	256 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	OR2L2	Q8NH16	312 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	HM13	Q8TCT9	377 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SNF8	Q96H20	258 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM74	Q96NL1	305 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PHF12	Q96QT6	1004 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	KIFC1	Q9BW19	673 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	DPH5	Q9H2P9	285 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TREX1	Q9NSU2	369 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SATB2	Q9UPW6	733 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	USP24	Q9UPU5	2620 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PFDN6	O15212	129 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SGTA	O43765	313 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	BRINP1	O60477	761 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	AP2A2	O94973	939 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	MLN	P12872	115 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	PSMA3	P25788	255 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	FASLG	P48023	281 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TTPA	P49638	278 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ITGA8	P53708	1063 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	DMPK	Q09013	629 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CAMK2B	Q13554	666 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR18	Q14330	331 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	METRNL	Q641Q3	311 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	KRT222	Q8N1A0	295 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR150	Q8NGU9	434 aa		9.41	□□□□□ -0.9

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