RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 RTCAO00442 366 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 FAAHO00519 579 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 KIF3BO15066 747 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 P2RX6O15547 441 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CHST1O43916 411 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 OR10H2O60403 315 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 LMX1BO60663 402 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CYTIPO60759 359 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 NR1I2O75469 434 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TADA2AO75478 443 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 FCHSD2O94868 740 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PEX11BO96011 259 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 IGKV3-20P01619 116 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 IGLV3-19P01714 112 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 P01737 135 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SCG5P05408 212 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PYGLP06737 847 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CRYGDP07320 174 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CHRM4P08173 479 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD34CP0C6C1 535 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 OSMP13725 252 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 HDCP19113 662 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 DDCP20711 480 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 RBL1P28749 1068 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TACR3P29371 465 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 GALNSP34059 522 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CCR2P41597 374 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PIK3CAP42336 1068 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SCTRP47872 440 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 NRIP1P48552 1158 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH9A1P49189 494 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 MTNR1BP49286 362 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PRIM2P49643 509 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINB9P50453 376 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PMS2P54278 862 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PRRX1P54821 245 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 NRLP54845 237 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 NCKAP1LP55160 1127 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 GABREP78334 506 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 DLG4P78352 724 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF33AQ06730 810 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SCN1BQ07699 218 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PPARAQ07869 468 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 AP3B2Q13367 1082 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CAMK2DQ13557 499 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 GRB14Q14449 540 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 WFDC2Q14508 124 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 LTB4RQ15722 352 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM241Q24JQ0 296 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
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SNORD54-201ENST00000459159 TMEM30BQ3MIR4 351 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 AMZ1Q400G9 498 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF385BQ569K4 471 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 EMC4Q5J8M3 183 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CERCAMQ5T4B2 595 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SFRP5Q5T4F7 317 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 IL23RQ5VWK5 629 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CHIC1Q5VXU3 224 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 FRG2Q64ET8 278 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 IL31Q6EBC2 164 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 LLGL2Q6P1M3 1020 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 BRAT1Q6PJG6 821 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 BRICD5Q6PL45 260 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF620Q6ZNG0 422 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZSR9 355 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 USP17L1Q7RTZ2 530 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SAMD7Q7Z3H4 446 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SYVN1Q86TM6 617 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ITIH5Q86UX2 942 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 FJX1Q86VR8 437 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ATCAYQ86WG3 371 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 GPSM1Q86YR5 675 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 LIX1Q8N485 282 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 RPRMLQ8N4K4 120 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM105Q8N8V8 129 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 THAP8Q8NA92 274 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 ATG16L2Q8NAA4 619 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 RCBTB1Q8NDN9 531 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 FAM13CQ8NE31 585 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 SPPL2AQ8TCT8 520 aa-2.05□□□□□ -2.74
SNORD54-201ENST00000459159 TRPC4APQ8TEL6 797 aa-2.05□□□□□ -2.74
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