RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf54	Q08AI8	447 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	CALCOCO2	Q13137	446 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	HIF1A	Q16665	826 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	DUPD1	Q68J44	220 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	PATE1	Q8WXA2	126 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	KLK13	Q9UKR3	277 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		14.35	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241		H3BMM5	538 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	PPM1D	O15297	605 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	CPNE6	O95741	557 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	VIP	P01282	170 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS56	P0CW18	603 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	BRAF	P15056	766 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS1	P28331	727 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	CAV1	Q03135	178 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	NFE2L1	Q14494	772 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	LONRF1	Q17RB8	773 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	NEPRO	Q6NW34	567 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	14.34	□□□□□ -0.11	2e-6	■■■■■ 146.1
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF592	Q92610	1267 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM74	Q96NL1	305 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	PANX3	Q96QZ0	392 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	CARD6	Q9BX69	1037 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	COG4	Q9H9E3	785 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	ACACB	O00763	2458 aa		14.34	□□□□□ -0.11
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQM1	296 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241		E7ESA3	106 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KPNA5	O15131	536 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TP73	O15350	636 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS3	O75489	264 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ESR1	P03372	595 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CCKBR	P32239	447 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SLC19A1	P41440	591 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CCL7	P80098	99 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CAMK2B	Q13554	666 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA3A	Q14563	771 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CRYM	Q14894	314 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	RPE65	Q16518	533 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ISX	Q2M1V0	245 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OR10G6	Q8NH81	332 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM159	Q96B96	161 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A3	Q99624	504 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	DKK4	Q9UBT3	224 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SPEG	Q15772	3267 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	B4GAT1	O43505	415 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	DUX1	O43812	170 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	OR1I1	O60431	355 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH4A1	P30038	563 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	CLCA4	Q14CN2	919 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPA-222	ENST00000445241	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12

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