RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 NCSTNQ92542 709 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 SCRN2Q96FV2 425 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PDXPQ96GD0 296 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 KLC2Q9H0B6 622 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 DUX1O43812 170 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 CCNFP41002 786 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 MGME1Q9BQP7 344 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 VCXQ9H320 206 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 CR2P20023 1033 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 MMP13P45452 471 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 NUMBP49757 651 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CDK3Q00526 305 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 KIR2DS5Q14953 304 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC188H7C350 402 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 J3KR12 359 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CEP104O60308 925 aa5.94□□□□□ -1.46
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