RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438929.5

BDNF-210, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,059 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-210ENST00000438929 MUC13Q9H3R2 512 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CDH7Q9ULB5 785 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FZD10Q9ULW2 581 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 USP22Q9UPT9 525 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ABCA4P78363 2273 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 BCORQ6W2J9 1755 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 FAM172BPA6NC97 362 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SH3BGRLO75368 114 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 OR4F21O95013 312 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TSPAN19P0C672 248 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PRKACBP22694 351 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CRHBPP24387 322 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LMO2P25791 158 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CD40LGP29965 261 aa6.09□□□□□ -1.43
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BDNF-210ENST00000438929 BACE1P56817 501 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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BDNF-210ENST00000438929 TTLL4Q14679 1199 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PYDC2Q56P42 97 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LCN8Q6JVE9 175 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 ERAP2Q6P179 960 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TRIM69Q86WT6 500 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GPSM1Q86YR5 675 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 HID1Q8IV36 788 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LSMEM2Q8N112 164 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CADM2Q8N3J6 435 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 COPS5Q92905 334 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 OTULINQ96BN8 352 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 OR52E6Q96RD3 313 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 GLOD4Q9HC38 313 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 IL37Q9NZH6 218 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 SPATA2Q9UM82 520 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.09□□□□□ -1.43
BDNF-210ENST00000438929 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.09□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 TEX28O15482 410 aa6.09□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 UGT2B11O75310 529 aa6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 SP2Q02086 613 aa6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.09□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 METTL23Q86XA0 190 aa6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 PIGVQ9NUD9 493 aa6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.09□□□□□ -1.44
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BDNF-210ENST00000438929 MYO10Q9HD67 2058 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SOBPA7XYQ1 873 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 PLOD3O60568 738 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SNX4O95219 450 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 SERPINA1P01009 418 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 EDN1P05305 212 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 NPR3P17342 541 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 S100A3P33764 101 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 HTR2BP41595 481 aa6.08□□□□□ -1.44
BDNF-210ENST00000438929 CTSKP43235 329 aa6.08□□□□□ -1.44
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