RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF10Q12962 218 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 VGLL4Q14135 290 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP15Q460N3 678 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 VSTM1Q6UX27 236 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC43A3Q8NBI5 491 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 HBEGFQ99075 208 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSS2Q9NR19 701 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PLK2Q9NYY3 685 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RIIAD1A6NNX1 92 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 C9JVG2 144 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MPZL2O60487 215 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 UGT2B4P06133 528 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 AKT2P31751 481 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA7P48741 367 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ECT2LQ008S8 904 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MADCAM1Q13477 382 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A6Q92581 669 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RFKQ969G6 155 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP295NLQ96MC4 621 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF304Q9HCX3 659 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCF5A8MTL0 148 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DNTTP04053 509 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLURP2P0DP57 97 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 UROSP10746 265 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDX6P30041 224 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CREMQ03060 361 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGKQ92643 395 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DNASE1L2Q92874 299 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCC1Q96S66 551 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF224Q9NZL3 707 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RAI2Q9Y5P3 530 aa10.88□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD4Q14839 1912 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX46H3BTG2 121 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 IRF6O14896 467 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ORC5O43913 435 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG13O75143 517 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF432O94892 652 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOQP17081 205 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GABRR2P28476 465 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN9P43378 593 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MXD1Q05195 221 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM139Q8IV31 216 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST4Q8NCG5 386 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMIZ2Q8NF64 920 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ROPN1LQ96C74 230 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GIN1Q9NXP7 522 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DERAQ9Y315 318 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM17Q9Y577 477 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFS2O75306 463 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ASGR1P07306 291 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPS2P11908 318 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF12P17014 697 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TIE1P35590 1138 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1AP35813 382 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CCR3P51677 355 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PTP4A2Q12974 167 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAP2Q15057 778 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FRRS1Q6ZNA5 592 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 AGAP2Q99490 1192 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF24Q9UPV7 400 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 POMPQ9Y244 141 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PQ67 120 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 OR14I1A6ND48 311 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LGR5O75473 907 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RYKP34925 604 aa10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms