RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 TNFSF15O95150 251 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 NMBRP28336 390 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEA6P43360 314 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SQSTM1Q13501 440 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SNAP47Q5SQN1 464 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 RCBTB1Q8NDN9 531 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC74BQ96LY2 380 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 DCBLD2Q96PD2 775 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CACNA1BQ00975 2339 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PLD2O14939 933 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCGO15287 622 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM63AO94886 807 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 TYRP1P17643 537 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 LIMK2P53671 638 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.49■■□□□ 1.51
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HTATSF1-202ENST00000425695 XKR5Q6UX68 686 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 FGF11Q92914 225 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC46A1Q96NT5 459 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 POT1Q9NUX5 634 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 LOXL2Q9Y4K0 774 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 OR1I1O60431 355 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 NSG1P42857 185 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHA4P54764 986 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR18Q14330 331 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA3AQ14563 771 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ITIH4Q14624 930 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM71Q6P5X7 295 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 MPP5Q8N3R9 675 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR150Q8NGU9 434 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 HM13Q8TCT9 377 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PEX13Q92968 403 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 C12orf66Q96MD2 445 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC1Q99614 292 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 TREX1Q9NSU2 369 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PISDQ9UG56 409 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ZZEF1O43149 2961 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL33A6NCF5 533 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 LILRA5A6NI73 299 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 A8MU76 341 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 DXOO77932 396 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 AP2A2O94973 939 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 JMJD7P0C870 316 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 AMD1P17707 334 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ITIH1P19827 911 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CASC4Q6P4E1 433 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD3Q96ES6 412 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CMKLR1Q99788 373 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 DPYSL5Q9BPU6 564 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 KIFC1Q9BW19 673 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 UCK1Q9HA47 277 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL3Q9UH77 587 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 UBXN7O94888 489 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PAFAH1B1P43034 410 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PTGIRP43119 386 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 CERS6Q6ZMG9 384 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 JAMLQ86YT9 394 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 MCUQ8NE86 351 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 COG4Q9H9E3 785 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 THSD1Q9NS62 852 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 KCND1Q9NSA2 647 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 OGFRQ9NZT2 677 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX13Q9UN79 622 aa24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1-202ENST00000425695 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1-202ENST00000425695 VAPBO95292 243 aa24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1-202ENST00000425695 THRAP10827 490 aa24.45■■□□□ 1.5
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