RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 AKAP10O43572 662 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ICMTO60725 284 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 NIPSNAP2O75323 286 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 SOD1P00441 154 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 IGLV3-19P01714 112 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 FTH1P02794 183 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 GABRG2P18507 467 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 RXRGP48443 463 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 RGS4P49798 205 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TPMTP51580 245 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 IL2P60568 153 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ATP6V0D1P61421 351 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 GABREP78334 506 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 PPARDQ03181 441 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 CSHL1Q14406 222 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 HORMAD1Q86X24 394 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 CD200R1Q8TD46 325 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 HMGB4Q8WW32 186 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ASB12Q8WXK4 309 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 INPP5DQ92835 1189 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 DERL2Q9GZP9 239 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 MED16Q9Y2X0 877 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 DHRS7Q9Y394 339 aa7.36□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 COL6A3P12111 3177 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 A0A1W2PQU0 124 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 DGKAP23743 735 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 OXTRP30559 389 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 HTR3AP46098 478 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 CLCN7P51798 805 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 B4GALNT1Q00973 533 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ASPHQ12797 758 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 GTF2H3Q13889 308 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT72Q14CN4 511 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 PNCKQ6P2M8 343 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TRIM69Q86WT6 500 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 GJD3Q8N144 294 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 PJA1Q8NG27 643 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC126Q96EE4 140 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 HIC2Q96JB3 615 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 EPN3Q9H201 632 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 CHRDQ9H2X0 955 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 FANCFQ9NPI8 374 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 COPG2Q9UBF2 871 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 XPR1Q9UBH6 696 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 EMCNQ9ULC0 261 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.35□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 GMNCA6NCL1 334 aa7.34□□□□□ -1.23
HIVEP1-202ENST00000399469 PRR23AA6NEV1 266 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms