RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCM2P49736 904 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SORDQ00796 357 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MECOMQ03112 1051 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 NAE1Q13564 534 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 EBI3Q14213 229 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHMP1BQ7LBR1 199 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM160B2Q86V87 743 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTOV1Q86YD1 416 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 EID3Q8N140 333 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYCT1Q8N699 235 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR6S1Q8NH40 331 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNFT2Q96EX2 444 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MASTLQ96GX5 879 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEP295NLQ96MC4 621 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATF6BQ99941 703 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM110AQ9BQ89 295 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADNPQ9H2P0 1102 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCND3Q9UK17 655 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUFUQ9UMX1 484 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM96BQ9Y3D0 163 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM90A26D6RGX4 464 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 PI4K2BG5E9Z4 385 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACTL6BO94805 426 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPIP06744 558 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MDKP21741 143 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 GIFP27352 417 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHMT1P34896 483 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSFMP43897 325 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRIM2P49643 509 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMP15P51511 669 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLCN4P51793 760 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 AP2B1P63010 937 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDONQ4KMG0 1287 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT39Q6A163 491 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q75L30 129 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 RASGRP2Q7LDG7 609 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPAT4Q86UL3 456 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZFAND4Q86XD8 727 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 KBTBD8Q8NFY9 601 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPK15Q8TD08 544 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB40AQ8WXH6 277 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 APBB2Q92870 758 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 MUL1Q969V5 352 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM122AQ96E09 287 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC32A1Q9H598 525 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 OLFML3Q9NRN5 406 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 DACT1Q9NYF0 836 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHISA7A6NL88 538 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 E7ENQ6 273 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 OGTO15294 1046 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRAK2O43187 625 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FTCDO95954 541 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 POU1F1P28069 291 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPS18P62269 152 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC63Q05C16 580 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 LGALS3BPQ08380 585 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAF11Q15544 211 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 OLIG1Q8TAK6 271 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 STAMQ92783 540 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 NTNG2Q96CW9 530 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP44Q9H0E7 712 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHST12Q9NRB3 414 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 YIPF1Q9Y548 306 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PQ72 361 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 E7EVH7 732 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV1-17P01599 117 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD5P06127 495 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 CKMT2P17540 419 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA7P48741 367 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 THOP1P52888 689 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDH15P55291 814 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRM3Q14832 879 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM209BQ5JX69 171 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-187P-201ENST00000384139 MARC1Q5VT66 337 aa0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms