RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 ACLYP53396 1101 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SMIM11AP58511 58 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CRHR2Q13324 411 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MYBPC3Q14896 1274 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GGA2Q9UJY4 613 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A1W2PRG6 482 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM172BPA6NC97 362 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 OR51F1A6NGY5 319 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 KERAO60938 352 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PRKAR1AP10644 381 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FUT10Q6P4F1 479 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 IQCHQ86VS3 1027 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RDH11Q8TC12 318 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SHDQ96IW2 340 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CAPN8A6NHC0 703 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 LAMP2P13473 410 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CASRP41180 1078 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TEX44Q53QW1 395 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MKL1Q969V6 931 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF570Q96NI8 536 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.56□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR25O00155 361 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFRSF11BO00300 401 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 IL33O95760 270 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP3A7P24462 503 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 AVPR1BP47901 424 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 NOMO1Q15155 1222 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 INAVAQ3KP66 663 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 OGFOD2Q6N063 350 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 BBS12Q6ZW61 710 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MEIOBQ8N635 442 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 GRHL3Q8TE85 626 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TSPAN1O60635 241 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SMCO1Q147U7 214 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CCNDBP1O95273 360 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CCNOP22674 350 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FSHRP23945 695 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CDH12P55289 794 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TTC27Q6P3X3 843 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CITED4Q96RK1 184 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CLCC1Q96S66 551 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CHIAQ9BZP6 476 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MARK1Q9P0L2 795 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CLDN9O95484 217 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 LAG3P18627 525 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP6V0D1P61421 351 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 TLR1Q15399 786 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 C12orf66Q96MD2 445 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 BCL9O00512 1426 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CLDN11O75508 207 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 BPGMP07738 259 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ADRA1BP35368 520 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 PRKCIP41743 596 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CHRNA4P43681 627 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 AKR1D1P51857 326 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A1W2PRU2 124 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 CAPGP40121 348 aa14.55□□□□□ -0.08
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC51AQ86UW1 340 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms