RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
LRRTM3-201ENST00000361320 KCND1Q9NSA2 647 aa6.96□□□□□ -1.29
LRRTM3-201ENST00000361320 IRAK3Q9Y616 596 aa6.96□□□□□ -1.29
LRRTM3-201ENST00000361320 TPST1O60507 370 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SRFP11831 508 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MAPK10P53779 464 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RASA2Q15283 850 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PKDCCQ504Y2 493 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 APOLD1Q96LR9 279 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB21Q9UL25 225 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EGFP01133 1207 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 JUPP14923 745 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 GNAZP19086 355 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EPORP19235 508 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IL10P22301 178 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CD6P30203 668 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CCR2P41597 374 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PTGIRP43119 386 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 OCA2Q04671 838 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 AVL9Q8NBF6 648 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PGM2Q96G03 612 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 C1orf50Q9BV19 199 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MECRQ9BV79 373 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TIMM22Q9Y584 194 aa6.96□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 UBXN8O00124 270 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 HS6ST1O60243 411 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 STATHP02808 62 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 C8GP07360 202 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IL9P15248 144 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 HOXC8P31273 242 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ADAM15Q13444 863 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CYTH1Q15438 398 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MAPK15Q8TD08 544 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 USP7Q93009 1102 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TSSK3Q96PN8 268 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IL21RQ9HBE5 538 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TMCO1Q9UM00 188 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR90Q96KV7 1748 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 C9J4A7 227 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CLDN4O14493 209 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 AZIN1O14977 448 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ECI2O75521 394 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT16P08779 473 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00032P0C843 101 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 LBPP18428 481 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CCNFP41002 786 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 TNFRSF4P43489 277 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 COPAP53621 1224 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP1B1Q16678 543 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 Q6ZSR6 202 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SCML4Q8N228 414 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 UBR7Q8N806 425 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 SCRN2Q96FV2 425 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.95□□□□□ -1.3
LRRTM3-201ENST00000361320 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms