RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GK5Q6ZS86 529 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 TRAM1L1Q8N609 369 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB3Q8N7B9 438 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SNX31Q8N9S9 440 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 PDPRQ8NCN5 879 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 OR8D1Q8WZ84 308 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 RCN3Q96D15 328 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 FAM129BQ96TA1 746 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A8Q9UHI5 535 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 PPM1HQ9ULR3 514 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 CHUKO15111 745 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 OR4F21O95013 312 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 GJA4P35212 333 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 FCHO2Q0JRZ9 810 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 GRB7Q14451 532 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SQLEQ14534 574 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 YAF2Q8IY57 180 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 CPA6Q8N4T0 437 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 TMIEQ8NEW7 156 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 OR52B6Q8NGF0 335 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 CDK15Q96Q40 435 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 TMEM245Q9H330 911 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 HCN2Q9UL51 889 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 COQ6Q9Y2Z9 468 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 CBSLP0DN79 551 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 CBSP35520 551 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 HSPA7P48741 367 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 NUDT2P50583 147 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 ERVPABLB-1P60509 514 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 E2F5Q15329 346 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 EGFL8Q99944 293 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 RAD18Q9NS91 495 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 KLHL42Q9P2K6 505 aa17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 H0Y3Z8 333 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 SGTAO43765 313 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CIB2O75838 187 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PDE5AO76074 875 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 UROSP10746 265 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 VCLP18206 1134 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 MSH3P20585 1137 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ITGB7P26010 798 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 HSPA14Q0VDF9 509 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GTF2H2Q13888 395 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CRY1Q16526 586 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 AGKQ53H12 422 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PARM1Q6UWI2 310 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 VRK3Q8IV63 474 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CHFRQ96EP1 664 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ZNF382Q96SR6 550 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ACOX2Q99424 681 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GDF15Q99988 308 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 C5orf42Q9H799 3197 aa17.58■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 OR7A17O14581 309 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 IL12RB1P42701 662 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GDF5P43026 501 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CREB5Q02930 508 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PTK2BQ14289 1009 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ZNF284Q2VY69 593 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ATAT1Q5SQI0 421 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PGM2L1Q6PCE3 622 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 FBXL19Q6PCT2 694 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CDYL2Q8N8U2 506 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 KYQ8NBH2 561 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 BTN2A2Q8WVV5 523 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 RHBDF1Q96CC6 855 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 AP2M1Q96CW1 435 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 COQ10AQ96MF6 247 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 NPAS2Q99743 824 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 TMEM79Q9BSE2 394 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 POLG2Q9UHN1 485 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 OR2AG2A6NM03 316 aa17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms