RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 AMZ2Q86W34 360 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NPWQ8N729 165 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MLKLQ8NB16 471 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GDAP1Q8TB36 358 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GLYATL1Q969I3 302 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PTERQ96BW5 349 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CNDP1Q96KN2 507 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BTRCQ9Y297 605 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.68□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNN4O15554 427 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MAFKO60675 156 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PMPCBO75439 489 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MLYCDO95822 493 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PDHA1P08559 390 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MSL3P1P0C860 447 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PYGMP11217 842 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGAXP20702 1163 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AGAP20933 346 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFAIP3P21580 790 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RORAP35398 523 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR19Q15760 415 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 INAQ16352 499 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BOLA3Q53S33 107 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PGBD5Q8N414 524 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf79Q96F83 325 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP85Q9BW27 656 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CHKBQ9Y259 395 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 POLEQ07864 2286 aa7.67□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DYTNA2CJ06 578 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GSAPA4D1B5 854 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AGPSO00116 658 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL21O00585 134 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCRHP07919 91 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DPA1P20036 260 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PTP4A2Q12974 167 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DPYSQ14117 519 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ALS2CLQ60I27 953 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GFRALQ6UXV0 394 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MON1BQ7L1V2 547 aa7.66□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP97Q8IW35 865 aa7.66□□□□□ -1.18
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