RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADAMDEC1O15204 470 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CHIT1Q13231 466 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC18A1P54219 525 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 PARP15Q460N3 678 aa13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PPW3 197 aa13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TAF8Q7Z7C8 310 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 COMMD3Q9UBI1 195 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 FABP12A6NFH5 140 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 STX16O14662 325 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC35G4P0C7Q5 338 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 AOC1P19801 751 aa13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CDK14O94921 469 aa13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LILRA4P59901 499 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHSY3Q70JA7 882 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 AKTIPQ9H8T0 292 aa13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPSM3Q9Y4H4 160 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 MAGEB17A8MXT2 336 aa13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ITGA3P26006 1051 aa13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NPTX1Q15818 432 aa13.44□□□□□ -0.26
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM171BQ6P995 826 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC51AQ86UW1 340 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF384Q8TF68 577 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 HCN1O60741 890 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 IFI30P13284 250 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 MNDAP41218 407 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 BCAP31P51572 246 aa13.44□□□□□ -0.26
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