RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CDYLQ9Y232 598 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PSAT1Q9Y617 370 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 E2F8A0AVK6 867 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL12A8MUP2 240 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ITM2AO43736 263 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 STAMBPO95630 424 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BAG2O95816 211 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OLFM2O95897 454 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GSRP00390 522 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV3-25P01717 112 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IRF1P10914 325 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBP50607 506 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB13P59910 316 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NAA20P61599 178 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NFATC3Q12968 1075 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB17Q13105 803 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBB3Q13509 450 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CUL3Q13618 768 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GRM3Q14832 879 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NR6A1Q15406 480 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS5Q8N3I7 341 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 STYXQ8WUJ0 223 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BHMTQ93088 406 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MED8Q96G25 268 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 WBP1Q96G27 269 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CNDP1Q96KN2 507 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FICDQ9BVA6 458 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 COG4Q9H9E3 785 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A14Q9HCY8 104 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NOTCH2Q04721 2471 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NHS1 94 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 G3V2L1 256 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PFDN6O15212 129 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA12O60330 932 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 USP12O75317 370 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PAGE1O75459 146 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGNO95427 931 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MYF5P13349 255 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOQP17081 205 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TPH1P17752 444 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NMBRP28336 390 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CPOXP36551 454 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC26A3P40879 764 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEA11P43364 429 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIA4P48058 902 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA13P48723 471 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACADVLP49748 655 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NUMBP49757 651 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TBX4P57082 545 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BTKQ06187 659 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF10Q12962 218 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF10Q13118 480 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ART3Q13508 389 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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