RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 KLHL2O95198 593 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 KELP23276 732 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 LINGO1Q96FE5 620 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TOR1BO14657 336 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 SLC34A2O95436 690 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TSPAN12O95859 305 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 WNT1P04628 370 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 GPR89BP0CG08 455 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 SP9P0CG40 484 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 ATP1A2P50993 1020 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 IL2P60568 153 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 PMS2CLQ68D20 193 aa22.59■■□□□ 1.21
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USF2-201ENST00000222305 MDM1Q8TC05 714 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 NELL1Q92832 810 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 KMOO15229 486 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 COL6A2P12110 1019 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 ITPKAP23677 461 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 CD38P28907 300 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 GNPDA1P46926 289 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 VRK3Q8IV63 474 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 MGARPQ8TDB4 240 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 GPR78Q96P69 363 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 RMI1Q9H9A7 625 aa22.58■■□□□ 1.21
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USF2-201ENST00000222305 GPR27Q9NS67 375 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 KLQ9UEF7 1012 aa22.58■■□□□ 1.21
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USF2-201ENST00000222305 INSCQ1MX18 579 aa22.57■■□□□ 1.2
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USF2-201ENST00000222305 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.57■■□□□ 1.2
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USF2-201ENST00000222305 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.57■■□□□ 1.2
USF2-201ENST00000222305 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.57■■□□□ 1.2
USF2-201ENST00000222305 XKR5Q6UX68 686 aa22.57■■□□□ 1.2
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