RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000037117.5

Gtf3c4-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 6,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Smim17A0A504 109 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr600E9PUN7 314 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Bmp4P21275 408 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mocs1Q5RKZ7 636 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 ArhgdibQ61599 200 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MogQ61885 246 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Adh7Q64437 374 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 SugctQ7TNE1 436 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rft1Q8C3B8 541 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Clptm1Q8VBZ3 664 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cog2Q921L5 731 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 TympQ99N42 471 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mageb16Q9CWV4 363 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Kctd4Q9D7X1 259 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zscan5bB2RTN3 468 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mapk12O08911 367 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gosr2O35166 212 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 PigrO70570 771 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MaxP28574 160 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Kcnj9P48543 393 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 SmoP56726 793 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Morf4l1P60762 362 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dppa5bP85965 119 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Col28a1Q2UY11 1141 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Npr2Q6VVW5 1047 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tecpr1Q80VP0 1166 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hdac7Q8C2B3 938 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem168Q91VX9 697 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Eps8l3Q91WL0 600 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Acbd7Q9D258 88 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Trim10Q9WUH5 489 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Nrxn1Q9CS84 1514 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rad21l1A2AU37 552 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mtx3D3YTP3 312 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Srp54bE9PXC0 504 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm7073E9QAS1 335 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ptpn9O35239 593 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MslnQ61468 625 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Entpd8Q8K0L2 497 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mtg1Q8R2R6 326 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dyrk3Q922Y0 586 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gdpd3Q99LY2 330 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Oma1Q9D8H7 521 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm8374L7N2A9 172 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ltb4rO88855 351 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mfsd14aP70187 490 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gch1Q05915 241 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rpusd2Q149F1 553 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MyrflQ3UN70 904 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hephl1Q3V1H3 1159 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ptpn21Q62136 1176 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dpysl3Q62188 570 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rpa2Q62193 270 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gpr17Q6NS65 339 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mfn1Q811U4 741 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rhbdd3Q8BP97 385 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dctn4Q8CBY8 467 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 PdgfcQ8CI19 345 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 IlkapQ8R0F6 392 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Armc10Q9D0L7 306 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 ArskQ9D2L1 553 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tsc22d4Q9EQN3 387 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mapk11Q9WUI1 364 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Nwd1A6H603 1563 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm17174M0QWQ9 212 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gnpda1O88958 289 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ccnd1P25322 295 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ube2e3P52483 207 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Camta2Q80Y50 1208 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem150cQ8C8S3 249 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr356Q8VFP5 315 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gemin6Q9CX53 166 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ptges3Q9R0Q7 160 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 TfebQ9R210 475 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 TesminQ9WTJ6 475 aa11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 PuraP42669 321 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rnft2Q3UF64 445 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr318Q5NCD7 306 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 NnatQ61979 81 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 CstbQ62426 98 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gdpd5Q640M6 607 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr998Q8VF76 314 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 RpainQ9CWY9 219 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Syde1Q9DBZ9 737 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Git2Q9JLQ2 708 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ssxb8B1AY40 170 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r30K7N5W1 852 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.1 ms