RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 LRRC3Q9BY71 257 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MPP6Q9NZW5 540 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GALPQ9UBC7 116 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 BTAF1O14981 1849 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 DFNA5O60443 496 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 IGFBP5P24593 272 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CD86P42081 329 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CLCN5P51795 746 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 UBE3AQ05086 875 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CAMK2BQ13554 666 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CLCA4Q14CN2 919 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CCDC58Q4VC31 144 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 ISCA2Q86U28 154 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 SVOPQ8N4V2 548 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 METTL6Q8TCB7 284 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MUL1Q969V5 352 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ZBTB18Q99592 522 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PSD2Q9BQI7 771 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 NTN4Q9HB63 628 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 GPR42O15529 346 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ZW10O43264 779 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 HBP1O60381 514 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 FYNP06241 537 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 DMC1Q14565 340 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ELMOD1Q8N336 334 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CADM2Q8N3J6 435 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.59□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 SNX6Q9UNH7 406 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.59□□□□□ -1.35
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