RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		24.54	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CPED1	A4D0V7	1026 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CKMT2	P17540	419 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PRLHR	P49683	370 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PACS1	Q6VY07	963 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		24.53	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229		F8W8V4	182 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	OR56A5	P0C7T3	313 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	IDS	P22304	550 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	NFE2L1	Q14494	772 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	CALML6	Q8TD86	181 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PATE1	Q8WXA2	126 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	24.52	■■□□□ 1.52
GPS1-223	ENST00000584229		E7ESA3	106 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	QSOX1	O00391	747 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	AP2A2	O94973	939 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	FTH1	P02794	183 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	ERVK-10	P10266	1014 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	ITGB6	P18564	788 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	PALM2	Q8IXS6	379 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CERS2	Q96G23	380 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	PADI4	Q9UM07	663 aa		24.51	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	MGAT4D	A6NG13	374 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	SGTA	O43765	313 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CKMT1A	P12532	417 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	SLC2A4	P14672	509 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	SLC1A2	P43004	574 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CTBP1	Q13363	440 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	SYTL3	Q4VX76	610 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	GUSBP11	Q6P575	273 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	GPR150	Q8NGU9	434 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	OR2L2	Q8NH16	312 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	IFI44	Q8TCB0	444 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	MAPK15	Q8TD08	544 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	SEC14L1	Q92503	715 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		24.5	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	NOBOX	O60393	691 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	KCNJ13	O60928	360 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	EML2	O95834	649 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	F3	P13726	295 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	BRD3	Q15059	726 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	NAGS	Q8N159	534 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	HM13	Q8TCT9	377 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	ELMO1	Q92556	727 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229		U3KQA8	63 aa		24.49	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	RFPL3	O75679	317 aa		24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM16	O95361	564 aa		24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	FMO4	P31512	558 aa		24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	HAL	P42357	657 aa		24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	ACADVL	P49748	655 aa		24.48	■■□□□ 1.51
GPS1-223	ENST00000584229	CLCNKA	P51800	687 aa		24.48	■■□□□ 1.51

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