RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	ELANE	P08246	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYL3	P08590	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT16	P08779	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CPE	P16870	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AKAP5	P24588	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TYK2	P29597	1187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PRDX6	P30041	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB5	P36952	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CXCR3	P49682	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB8	P50452	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TKTL1	P51854	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TPI1	P60174	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CXADR	P78310	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPY1	Q01534	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GBE1	Q04446	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH17	Q12864	832 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYM	Q14894	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289		Q96MF0	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RILP	Q96NA2	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SCN1A	P35498	2009 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FCHO1	O14526	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DCLK1	O15075	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CREB3	O43889	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AVIL	O75366	819 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QA	P02745	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RARB	P10826	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYL2	P10916	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RALB	P11234	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CPA3	P15088	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ACADS	P16219	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GOT1	P17174	413 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ERCC2	P18074	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AOC1	P19801	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TYMP	P19971	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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