RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572905.1

TOM1L1-215, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-215	ENST00000572905	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PTAFR	P25105	342 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SSTR2	P30874	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	COPB2	P35606	906 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	GLUD2	P49448	558 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PEX5	P50542	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	TERF1	P54274	439 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PDE1B	Q01064	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	MELK	Q14680	651 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	STK26	Q9P289	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PTPRC	P08575	1304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	C22orf31	O95567	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRSS2	P07478	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	IFNAR1	P17181	557 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	DNASE1	P24855	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CCKAR	P32238	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PCGF2	P35227	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PCYT1A	P49585	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF75D	P51815	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRT83	P78385	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	RBP5	P82980	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDK3	Q00526	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PPARD	Q03181	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	DDR1	Q08345	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	BFSP1	Q12934	665 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	HSPB3	Q12988	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRT39	Q6A163	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905		Q8NFD4	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CSF3R	Q99062	836 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905		A0A1W2PP11	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	S1PR1	P21453	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	GP5	P40197	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	CCR10	P46092	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	PIGT	Q969N2	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-215	ENST00000572905	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905		A0A0B4J293	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	PLK4	O00444	970 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ALPL	P05186	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ITGB8	P26012	769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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