RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	IQCF5	A8MTL0	148 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SUPT3H	O75486	399 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	HLA-E	P13747	358 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	BPI	P17213	487 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CLCN7	P51798	805 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CDH13	P55290	713 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	MTAP	Q13126	283 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CUL3	Q13618	768 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CHSY3	Q70JA7	882 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	AHI1	Q8N157	1196 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	LINGO1	Q96FE5	620 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	MSANTD3	Q96H12	275 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	LYSMD1	Q96S90	227 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	RTKN	Q9BST9	563 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	EBF2	Q9HAK2	575 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	IL26	Q9NPH9	171 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279		H0Y3Z8	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	BTN3A1	O00481	513 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PPP6C	O00743	305 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	KLK8	O60259	260 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ADAM23	O75077	832 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	KRT36	O76013	467 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CDK14	O94921	469 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ANP32D	O95626	131 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	THRA	P10827	490 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	GFAP	P14136	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	GNAZ	P19086	355 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CHRM3	P20309	590 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	IL12RB1	P42701	662 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	IL2	P60568	153 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SH3BP2	P78314	561 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	NFATC2	Q13469	925 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF234	Q14588	700 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	HERC3	Q15034	1050 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ACCSL	Q4AC99	568 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ICE2	Q659A1	982 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SNX20	Q7Z614	316 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CACUL1	Q86Y37	369 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CHPF	Q8IZ52	775 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PAF1	Q8N7H5	531 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CEP44	Q9C0F1	390 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	SYCE1L	A8MT33	242 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279		A8MX80	341 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279		E5RI56	91 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	BNIP3L	O60238	219 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CIB2	O75838	187 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ITGAL	P20701	1170 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	COL9A1	P20849	921 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TCF4-231	ENST00000566279	ECT2L	Q008S8	904 aa		10	□□□□□ -0.81

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