RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GPR150Q8NGU9 434 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PRR7Q8TB68 274 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLCO2A1Q92959 643 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 HDAC10Q969S8 669 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ULK4Q96C45 1275 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 METRNQ9UJH8 293 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.38□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 TP73O15350 636 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MSH3P20585 1137 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ADRA1DP25100 572 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 IVDP26440 423 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 NMBRP28336 390 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 AKT1P31749 480 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLC19A1P41440 591 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CYP4F3Q08477 520 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PTK6Q13882 451 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GTF2H3Q13889 308 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SPIDRQ14159 915 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RTP5Q14D33 572 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GPR33Q49SQ1 333 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CES3Q6UWW8 571 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 C4orf22Q6V702 233 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LRRC45Q96CN5 670 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MFSD3Q96ES6 412 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SERPINB12Q96P63 405 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 COPS8Q99627 209 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 KIFC1Q9BW19 673 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RDH14Q9HBH5 336 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 OGFRQ9NZT2 677 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 DKK4Q9UBT3 224 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 ITPR1Q14643 2758 aa8.37□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CHD6Q8TD26 2715 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 A0A0G2JNG1 304 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CTAGE9A4FU28 777 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MGAT4DA6NG13 374 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 LILRA5A6NI73 299 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 OR1I1O60431 355 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 BRINP1O60477 761 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 BANF1O75531 89 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 MPOP05164 745 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 THRAP10827 490 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 CCKBRP32239 447 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC33-211ENST00000563951 GPR3P46089 330 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms