RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	PRL	P01236	227 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PSMB4	P28070	264 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TSPAN7	P41732	249 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	STAT5A	P42229	794 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GNPDA1	P46926	289 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MC2R	Q01718	297 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RALGDS	Q12967	914 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MTM1	Q13496	603 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TRIB3	Q96RU7	358 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PMPCB	O75439	489 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RFPL1	O75677	317 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ANXA9	O76027	345 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	METTL18	O95568	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CP	P00450	1065 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	IFNB1	P01574	187 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	FNTA	P49354	379 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	WNT3A	P56704	352 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CDK18	Q07002	472 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MPP3	Q13368	585 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PTPRR	Q15256	657 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222		Q8NA96	180 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222		A0A0U1RQS6	177 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	EPO	P01588	193 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CEACAM5	P06731	702 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ETS1	P14921	441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MMP12	P39900	470 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GEM	P55040	296 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CTBS	Q01459	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	BIRC2	Q13490	618 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PCSK7	Q16549	785 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	F8	P00451	2351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222		A0A0J9YYE9	177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NDST3	O95803	873 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	DDAH2	O95865	285 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	TRBC1	P01850	177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	ADRA1A	P35348	466 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	MAPK9	P45984	424 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	PMS2	P54278	862 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	NR6A1	Q15406	480 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-231	ENST00000552222	QPCT	Q16769	361 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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