RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 APLP1P51693 650 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 AP3S2P59780 193 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 INCA1Q0VD86 236 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CTBP1Q13363 440 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GPR21Q99679 349 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 IPPKQ9H8X2 491 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 F2P00734 622 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 PRKAG1P54619 331 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 MAXP61244 160 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 BTBD9Q96Q07 612 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 GPR17Q13304 367 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 UBXN11Q5T124 520 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 OR10G6Q8NH81 332 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 COL20A1Q9P218 1284 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CBX6O95503 412 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CD247P20963 164 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GSTM3P21266 225 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CDH3P22223 829 aa8.4□□□□□ -1.06
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