RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD7Q92527 254 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 LTN1O94822 1766 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TSPOAP1O95153 1857 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 NPHP3Q7Z494 1330 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CTAGE9A4FU28 777 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 HHLA1C9JL84 531 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 AP5Z1O43299 807 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FIBPO43427 364 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SYNGR3O43761 229 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CAVIN2O95810 425 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CTAGE8P0CG41 777 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CCDC192P0DO97 292 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 GJB2P29033 226 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 HOXC13P31276 330 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 GRK6P43250 576 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 GNB1P62873 340 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SORDQ00796 357 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FOXM1Q08050 763 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 GRIK2Q13002 908 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 NECTIN1Q15223 517 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 LPAL2Q16609 132 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TXNDC8Q6A555 127 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TICAM2Q86XR7 235 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 EVI5LQ96CN4 794 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 LINGO1Q96FE5 620 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PCYT2Q99447 389 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 POLG2Q9UHN1 485 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 GUCY1B2O75343 617 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 IGLV1-44P01699 117 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 URODP06132 367 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FAM106CPP0CH98 169 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PSMA5P28066 241 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ARL4CP56559 192 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 DMTNQ08495 405 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 NAE1Q13564 534 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 WDR38Q5JTN6 314 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FRG2Q64ET8 278 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SARM1Q6SZW1 724 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 OR52I2Q8NH67 350 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 KIF3AQ9Y496 699 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TMEM94Q12767 1356 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 C5P01031 1676 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 KIF1AQ12756 1690 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 CRLF1O75462 422 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 FASLGP48023 281 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-211ENST00000522045 ZNF75DP51815 510 aa4.49□□□□□ -1.69
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