RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 SOX3P41225 446 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 LMAN1P49257 510 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 MMP15P51511 669 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 RIPK4P57078 832 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 KRTAP12-3P60328 96 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 CD300CQ08708 224 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 VEPH1Q14D04 833 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 KIF6Q6ZMV9 814 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPAT4Q86UL3 456 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 C2CD5Q86YS7 1000 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 LINS1Q8NG48 757 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR4C3Q8NH37 302 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 NPRL2Q8WTW4 380 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 AZIN2Q96A70 460 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 KIAA1191Q96A73 305 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUS1Q96E22 293 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PITPNM3Q9BZ71 974 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 EPHX3Q9H6B9 360 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM168BA1KXE4 195 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 C15orf62A8K5M9 175 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PER2O15055 1255 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATP6V0E1O15342 81 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 POU1F1P28069 291 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 THOP1P52888 689 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDH11P55287 796 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SORDQ00796 357 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 OLIG2Q13516 323 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 NAE1Q13564 534 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 RUNX3Q13761 415 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PQLC2Q6ZP29 291 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 RRAGAQ7L523 313 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ENTHD1Q8IYW4 607 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 DNAJC22Q8N4W6 341 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF561Q8N587 486 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLHDC1Q8N7A1 406 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 NUP37Q8NFH4 326 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 KBTBD8Q8NFY9 601 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATP8B4Q8TF62 1192 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SH3KBP1Q96B97 665 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 EID2BQ96D98 161 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 NSL1Q96IY1 281 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 TBCBQ99426 244 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM110AQ9BQ89 295 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 TUBB1Q9H4B7 451 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SNTG1Q9NSN8 517 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 FAM96BQ9Y3D0 163 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF175Q9Y473 711 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 MSGN1A6NI15 193 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SHISA7A6NL88 538 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 VCYO14598 125 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPIP06744 558 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 UGT1A1P22309 533 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SERPINF1P36955 418 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PNLIPRP1P54315 467 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDH15P55291 814 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAF11Q15544 211 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATAD3CQ5T2N8 411 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 QSOX2Q6ZRP7 698 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIGZQ86VD9 579 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 FMNL3Q8IVF7 1028 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 MARVELD2Q8N4S9 558 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 NIPA2Q8N8Q9 360 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 APBB2Q92870 758 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 TTC17Q96AE7 1141 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC41A2Q96JW4 573 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 MED20Q9H944 212 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 G6PC2Q9NQR9 355 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHST12Q9NRB3 414 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SERINC1Q9NRX5 453 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 KIAA1456Q9P272 454 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC7A7Q9UM01 511 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 A0A1W2PQ72 361 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 E7EVH7 732 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-772P-201ENST00000516042 PI4K2BG5E9Z4 385 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms