RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAFK	O60675	156 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CNTN5	O94779	1100 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRSS56	P0CW18	603 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MATN1	P21941	496 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CRY1	Q16526	586 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SNPH	O15079	494 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAD51B	O15315	384 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDH1	P12830	882 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	S100A3	P33764	101 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNC1	P48547	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	OXCT1	P55809	520 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TBX1	O43435	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TBX18	O95935	607 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	OPRL1	P41146	370 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	VBP1	P61758	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR4D1	Q15615	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CST9	Q5W186	159 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CGREF1	Q99674	301 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MYO1D	O94832	1006 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNAJB1	P25685	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	EMP3	P54852	163 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAB15	P59190	212 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ERVK-8	P63133	956 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	S1PR4	O95977	384 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	G6PD	P11413	515 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HSD17B1	P14061	328 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGFBP5	P24593	272 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	POU1F1	P28069	291 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR78	Q96P69	363 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TSSK3	Q96PN8	268 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RGS14	O43566	566 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ULK1	O75385	1050 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TULP3	O75386	442 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	FGF1	P05230	155 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMBIM6	P55061	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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