RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 USP12O75317 370 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 GPR32O75388 356 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TAF5LO75529 589 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA3DO95025 777 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD16AO95870 558 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SLC16A8O95907 504 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 UGT2B4P06133 528 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PGK2P07205 417 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CHRM2P08172 466 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CPOXP36551 454 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NCKAP1LP55160 1127 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 RIPK4P57078 832 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 RAB4BP61018 213 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 GALK2Q01415 458 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 GLO1Q04760 184 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CACNG1Q06432 222 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SMARCB1Q12824 385 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SLAQ13239 276 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFA5Q16718 116 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 EPC2Q52LR7 807 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 MLIPQ5VWP3 458 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZS46 218 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ANO5Q75V66 913 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PAQR7Q86WK9 346 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF677Q86XU0 584 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 IRGQQ8WZA9 623 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CNPY3Q9BT09 278 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 GON7Q9BXV9 100 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 P2RY12Q9H244 342 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 UBQLN3Q9H347 655 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 HEY2Q9UBP5 337 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS50Q9UI38 385 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SNX7Q9UNH6 387 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PIPSLA2A3N6 862 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ARGFXA6NJG6 315 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 TEX22C9J3V5 150 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SYN3O14994 580 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 FANCGO15287 622 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 GRID2O43424 1007 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 HS6ST1O60243 411 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFB10O96000 172 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 MBP02144 154 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 AMY2AP04746 511 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 G6PDP11413 515 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 MLNP12872 115 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SRMP19623 302 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 AMY2BP19961 511 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ACHEP22303 614 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ACVR2AP27037 513 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 LRPAP1P30533 357 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SLC1A4P43007 532 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 RAP1GDS1P52306 607 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 PRPS1P60891 318 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 BNC1Q01954 994 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC63Q05C16 580 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 CTBP1Q13363 440 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A14Q15043 492 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 MAPK6Q16659 721 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 EOGTQ5NDL2 527 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.17□□□□□ -1.26
PDCD4-211ENST00000498367 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms