RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 TAC4Q86UU9 113 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5H6Q8NGV6 325 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR152Q8TDT2 470 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CALML4Q96GE6 196 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MBOAT7Q96N66 472 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KLK14Q9P0G3 267 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HCSTQ9UBK5 93 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BRWD1Q9NSI6 2320 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0U1RQV5 110 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC160A6NGH7 325 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A6NLC8 198 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL8A6PVC2 850 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PLK4O00444 970 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ACOX3O15254 700 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNG3O60359 315 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SCO1O75880 301 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OAZ2O95190 189 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EPOP01588 193 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TNNI1P19237 187 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MCM7P33993 719 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTPD1P49961 510 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRRX1P54821 245 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CDH6P55285 790 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NCALDP61601 193 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1A4Q13733 1029 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AFMIDQ63HM1 303 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ASCL5Q7RTU5 278 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF18BQ86Y91 864 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MICU2Q8IYU8 434 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BEST2Q8NFU1 509 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BBS10Q8TAM1 723 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NANPQ8TBE9 248 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TP53INP1Q96A56 240 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTERQ96BW5 349 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 R4GN57 208 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PCM1Q15154 2024 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LCTP09848 1927 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HTTP42858 3142 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1B0GV90 55 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6C75A6NL08 312 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM38O00635 465 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EFSO43281 561 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MAN1A2O60476 641 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP3O75074 770 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RASAL1O95294 804 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FCER2P06734 321 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SP9P0CG40 484 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 STAG3L3P0CL85 134 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CKMT1AP12532 417 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP5P24588 427 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CD79BP40259 229 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR3DL2P43630 455 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CXCL12P48061 93 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP5CP53041 499 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CHIT1Q13231 466 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 HTR4Q13639 388 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM187BQ17R55 369 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MLIPQ5VWP3 458 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPD8Q6UX82 237 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NETO1Q8TDF5 533 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms