RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 GSTM4Q03013 218 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 C2orf54Q08AI8 447 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SQSTM1Q13501 440 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 KIR2DS5Q14953 304 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 NR1D2Q14995 579 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 DBN1Q16643 649 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 METRNLQ641Q3 311 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 GUSBP11Q6P575 273 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 AMZ2Q86W34 360 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CCNJLQ8IV13 435 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SFRP1Q8N474 314 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ARL14Q8N4G2 192 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 MMGT1Q8N4V1 131 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 GPR150Q8NGU9 434 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 WDR48Q8TAF3 677 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 IFI44Q8TCB0 444 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SEC14L1Q92503 715 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF592Q92610 1267 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 NAT6Q93015 286 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 LRRC39Q96DD0 335 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SGF29Q96ES7 293 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 DCUN1D1Q96GG9 259 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SNF8Q96H20 258 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TCF12Q99081 682 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 NAT9Q9BTE0 207 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 KLC4Q9NSK0 619 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 GULP1Q9UBP9 304 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 KCNK6Q9Y257 313 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SNX24Q9Y343 169 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.29□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 DOCK9Q9BZ29 2069 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM131Q92545 1883 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CACNA1HO95180 2353 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC78A2IDD5 438 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 OR2AG2A6NM03 316 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 B4DGG1 531 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 E7ESA3 106 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 F8W8V4 182 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 PPM1DO15297 605 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SIAH2O43255 324 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ZW10O43264 779 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 OPA1O60313 960 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 VAPBO95292 243 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TTC4O95801 387 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 EML2O95834 649 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 OR56A5P0C7T3 313 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 PRSS56P0CW18 603 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 F3P13726 295 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 BRAFP15056 766 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 AKT1P31749 480 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 GPR3P46089 330 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TTPAP49638 278 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 ARL4CP56559 192 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CAV1Q03135 178 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CALCOCO2Q13137 446 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 RPA4Q13156 261 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SEMA3AQ14563 771 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TCEA2Q15560 299 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 INSCQ1MX18 579 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 TYSND1Q2T9J0 566 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 SPANXN3Q5MJ09 141 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 PERM1Q5SV97 790 aa5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SRPRB-205ENST00000494297 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms