RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 ETAA1Q9NY74 926 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 GRHL1Q9NZI5 618 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PCSK1NQ9UHG2 260 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ANAPC5Q9UJX4 755 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CDH9Q9ULB4 789 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 NME7Q9Y5B8 376 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 SNX8Q9Y5X2 465 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.89□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF487B1APH4 448 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 SGK1O00141 431 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TULP2O00295 520 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 DNM1LO00429 736 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CLDN5O00501 218 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PEX12O00623 359 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 STX16O14662 325 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CAPN9O14815 690 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 MDM4O15151 490 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 INPPL1O15357 1258 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 RIPK2O43353 540 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 DOK2O60496 412 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CST8O60676 142 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ATP2C2O75185 946 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 VPS4BO75351 444 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PTP4A3O75365 173 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TULP3O75386 442 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 B3GAT3O94766 335 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 APOC2P02655 101 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 DNTTP04053 509 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 APOA4P06727 396 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CD48P09326 243 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 NUDT17P0C025 328 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 LAMP2P13473 410 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 RARGP13631 454 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 HK1P19367 917 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TGM2P21980 687 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 KLRC2P26717 231 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TKTP29401 623 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 BSGP35613 385 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 GSTM5P46439 218 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PCP4P48539 62 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 LMAN1P49257 510 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 VPS41P49754 854 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 SULT1E1P49888 294 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ARSEP51690 589 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TKTL1P51854 596 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 DGKQP52824 942 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PTTG1IPP53801 180 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CDH6P55285 790 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 HDAC4P56524 1084 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 MAP3K7CLP57077 242 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TSPY1Q01534 308 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ROR1Q01973 937 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ADIGQ0VDE8 80 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 BFSP2Q13515 415 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 RIN1Q13671 783 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CBFBQ13951 182 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CAMK1Q14012 370 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 DPYSL3Q14195 570 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 UPP1Q16831 310 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ST3GAL2Q16842 350 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 P3H1Q32P28 736 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 KRT71Q3SY84 523 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 GALNTL6Q49A17 601 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC14Q49A88 953 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 BOLA3Q53S33 107 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TTMPQ5BVD1 217 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 NOMO2Q5JPE7 1267 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CEP85LQ5SZL2 805 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ERMARDQ5T6L9 678 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 AGBL2Q5U5Z8 902 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 TRNP1Q6NT89 227 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CLEC20AQ6ZU45 233 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ARCQ7LC44 396 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 STRADAQ7RTN6 431 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa2.88□□□□□ -1.95
SMYD3-215ENST00000490322 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms