RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB123Q8N688 67 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SCAMP4Q969E2 229 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCT7Q99832 543 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KLC4Q9NSK0 619 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 STOML1Q9UBI4 398 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.17□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 MID1O15344 667 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SNX3O60493 162 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ECI2O75521 394 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ITGB7P26010 798 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 PTPRCAPQ14761 206 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF77Q15935 545 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CHSY3Q70JA7 882 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RRM2BQ7LG56 351 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 JADE3Q92613 823 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FATE1Q969F0 183 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GBP5Q96PP8 586 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IPPKQ9H8X2 491 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PARP14Q460N5 1801 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 EP400Q96L91 3159 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NEMP2A6NFY4 417 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC160A6NGH7 325 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GRID2O43424 1007 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DCXO43602 365 aa8.17□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 PEX11AO75192 247 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GABBR2O75899 941 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN9O95484 217 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CFIP05156 583 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PDHA1P08559 390 aa8.17□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 MAGEA6P43360 314 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA7P48741 367 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PNLIPRP1P54315 467 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ARF5P84085 180 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 KRT72Q14CN4 511 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KDELC1Q6UW63 502 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IL21Q9HBE4 155 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AGPSO00116 658 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SH3BGRLO75368 114 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 S100A3P33764 101 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF4P43489 277 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A11P48066 632 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PLIN5Q00G26 463 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TMIEQ8NEW7 156 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 PADI4Q9UM07 663 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRD-211ENST00000486161 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SPINT3P49223 89 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HNMTP50135 292 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PRKCQQ04759 706 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CLCQ05315 142 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KYQ8NBH2 561 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HM13Q8TCT9 377 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC138Q96M89 665 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MIPEPQ99797 713 aa8.16□□□□□ -1.1
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