RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IFITM2Q01629 132 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRAF3Q13114 568 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 KCNAB2Q13303 367 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM209AQ5JX71 171 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.162e-6■□□□□ 8.5
CCSAP-204ENST00000483092 ROPN1LQ96C74 230 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF221Q9UK13 617 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA1P02708 482 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LHX1P48742 406 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR4D2P58180 307 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC58Q4VC31 144 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PELI3Q8N2H9 469 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ESAMQ96AP7 390 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AMBNQ9NP70 447 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AXIN1O15169 862 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CD40LGP29965 261 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TUBA3CQ13748 450 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM60Q495X7 471 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP69Q49AA0 526 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CEP19Q96LK0 163 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GABRDO14764 452 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ANGPTL1O95841 491 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GSTM2P28161 218 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM2Q99965 735 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PADI3Q9ULW8 664 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 BPTFQ12830 3046 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RGS5O15539 181 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MGEA5O60502 916 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HSMCR30P0CW71 290 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IFI30P13284 250 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PIGAP37287 484 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FOXA1P55317 472 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SPRED1Q7Z699 444 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NT5C3BQ969T7 300 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 UGT2B11O75310 529 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CPNE6O95741 557 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SPNP16150 400 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NPY2RP49146 381 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GPR15P49685 360 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 E2F2Q14209 437 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 METTL23Q86XA0 190 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MIB1Q86YT6 1006 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FRS2Q8WU20 508 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT8Q8WV74 236 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 B3GALT6Q96L58 329 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.03■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF10AO00220 468 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DYRK3O43781 588 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LBPP18428 481 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HADHAP40939 763 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH3A2P51648 485 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DDR2Q16832 855 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PIM3Q86V86 326 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.02■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM162AQ96A26 154 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms