RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIM3Q86V86 326 aa16.42■□□□□ 0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTX2O75431 263 aa16.4■□□□□ 0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALK1P51570 392 aa16.4■□□□□ 0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FPGTO14772 594 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJA2O60884 412 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATG13O75143 517 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNA13Q14344 377 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COMMD2Q86X83 199 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIX1Q8N485 282 aa16.4■□□□□ 0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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