RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482821.5

MRPS5-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene MRPS5, Length 3,680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS5-208	ENST00000482821	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	MAPK15	Q8TD08	544 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	FRS2	Q8WU20	508 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	FGF14	Q92915	247 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	NUS1	Q96E22	293 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	GDF15	Q99988	308 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	HPS4	Q9NQG7	708 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	NOTCH4	Q99466	2003 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821		H0Y3Z8	333 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	QSOX1	O00391	747 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	FFAR2	O15552	330 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	STAMBP	O95630	424 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	LCP2	Q13094	533 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	SGCG	Q13326	291 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	GALNTL6	Q49A17	601 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	TTC23L	Q6PF05	361 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	TRIM74	Q86UV6	250 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	PLPP6	Q8IY26	295 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	LMLN	Q96KR4	655 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	LYSMD1	Q96S90	227 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	TMCO1	Q9UM00	188 aa		9.09	□□□□□ -0.95
MRPS5-208	ENST00000482821	PTPRS	Q13332	1948 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	ATG13	O75143	517 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CTSL	P07711	333 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	LINC00032	P0C843	101 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	THRA	P10827	490 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	ACADM	P11310	421 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CASP2	P42575	452 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	RPIA	P49247	311 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	NUDT2	P50583	147 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	AGK	Q53H12	422 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	UNC50	Q53HI1	259 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	EPGN	Q6UW88	154 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	LIPI	Q6XZB0	460 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	SNX32	Q86XE0	403 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	KLK6	Q92876	244 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	MYOC	Q99972	504 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	ACTR8	Q9H981	624 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	SARDH	Q9UL12	918 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	DNTT	P04053	509 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	ADRB3	P13945	408 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	9.08	□□□□□ -0.96	4e-8	■■■■□ 25.2
MRPS5-208	ENST00000482821	ARRB2	P32121	409 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CREB5	Q02930	508 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	KRT72	Q14CN4	511 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	FAM124A	Q86V42	546 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	OR2AG1	Q9H205	316 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	NUMA1	Q14980	2115 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	PCCB	P05166	539 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	KLF10	Q13118	480 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	TREML1	Q86YW5	311 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	HIPK4	Q8NE63	616 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	GLYATL1	Q969I3	302 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	C19orf60	Q96EN9	201 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	DKK3	Q9UBP4	350 aa		9.08	□□□□□ -0.96
MRPS5-208	ENST00000482821	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		9.08	□□□□□ -0.96

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