RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0X1KG70 313 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPHS1O60500 1241 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLR5O60602 858 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB6Q15916 424 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GULP1Q9UBP9 304 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXCR6O00574 342 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASMTP46597 345 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BSNDQ8WZ55 320 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TP53INP1Q96A56 240 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF10O60809 474 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGLSO95336 258 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFNW1P05000 195 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRNB2P17787 502 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPA7P48741 367 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDH12P55289 794 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C9orf64Q5T6V5 341 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP43Q70EL4 1123 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAPNS2Q96L46 248 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBC1D24Q9ULP9 559 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNTNAP1P78357 1384 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSR2P43308 183 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2orf80Q0P641 193 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLK2Q6UY11 383 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP6V1G1O75348 118 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IKBKEQ14164 716 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPPE1Q53F39 396 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF613Q6PF04 617 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STYXQ8WUJ0 223 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAVCR1Q96D42 359 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCN2BO60939 215 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK16O75716 305 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNB2O95067 398 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MON1AQ86VX9 555 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP2M1Q96CW1 435 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBATAQ96M53 351 aa16.98■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 E9PAM4 449 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FZD9O00144 591 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4F21O95013 312 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFNA6P05013 189 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNCP24863 283 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF132P52740 706 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL23P55773 120 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DSC2Q02487 901 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL22O00626 93 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POU2F1P14859 743 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRCC3P46736 316 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDH1Q08174 1060 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRB14Q14449 540 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARP15Q460N3 678 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMDEC1O15204 470 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL1BP01584 269 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTR3P61158 418 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNG1Q06432 222 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD46Q86W74 232 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF570Q96NI8 536 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CORO1BQ9BR76 489 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOR3AQ9H497 397 aa16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBX1O43435 398 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms