RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC66A2RUB6 948 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 LRRD1A4D1F6 860 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 APOL1O14791 398 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SPOPO43791 374 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 NUAK1O60285 661 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SPAG6O75602 509 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 KIAA0754O94854 1291 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CLDN1O95832 211 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 GPR89BP0CG08 455 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 COMTP21964 271 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 VAV2P52735 878 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GFERP55789 205 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 DNASE1L3Q13609 305 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ODF2Q5BJF6 829 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC66Q68CR7 880 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 DENND2CQ68D51 928 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM135Q86UB9 458 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM139Q8IV31 216 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PAF1Q8N7H5 531 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 Q8NA96 180 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RAPGEF5Q92565 580 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SCAMP4Q969E2 229 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 OR6C1Q96RD1 312 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 VAT1Q99536 393 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ZMYND15Q9H091 742 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 LHX9Q9NQ69 397 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 CD84Q9UIB8 345 aa7.53□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.53□□□□□ -1.2
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RBBP4-211ENST00000477563 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 CHUKO15111 745 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 KATNA1O75449 491 aa7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 CTPS1P17812 591 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 SH3BP2P78314 561 aa7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 FOXM1Q08050 763 aa7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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RBBP4-211ENST00000477563 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 CT55Q8WUE5 264 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RBBP4-211ENST00000477563 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.52□□□□□ -1.21
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