RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464702.6

PDPK1-208, Transcript of 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1, human

TSL 2

Gene PDPK1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDPK1-208	ENST00000464702	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702		A0A1B0GUV1	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	VILL	O15195	856 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	SLC16A5	O15375	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TXNL1	O43396	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	KLHL41	O60662	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TBX10	O75333	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TSPAN9	O75954	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ABCA8	O94911	1581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	FTCD	O95954	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	HOXB5	P09067	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	SRC	P12931	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	IL7R	P16871	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	IFNAR1	P17181	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	MAOA	P21397	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TM4SF1	P30408	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ARL3	P36405	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	RAD23A	P54725	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	PSMC6	P62333	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	KYNU	Q16719	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDPK1-208	ENST00000464702	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	MID1	O15344	667 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	ZBTB43	O43298	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	ADAM20	O43506	726 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	KERA	O60938	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	SNX4	O95219	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	NFKBIA	P25963	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	MECOM	Q03112	1051 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	CTF1	Q16619	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDPK1-208	ENST00000464702	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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