RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CTSC	P53634	463 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SIRPA	P78324	504 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PIGT	Q969N2	578 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GFI1	Q99684	422 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZWINT	O95229	277 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	APOA4	P06727	396 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KCNA5	P22460	613 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	NMBR	P28336	390 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RGS19	P49795	217 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KYNU	Q16719	465 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PCYT2	Q99447	389 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	OR10A4	Q9H209	315 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LILRA5	A6NI73	299 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		H7C0S8	307 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TULP2	O00295	520 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CAMTA2	O94983	1202 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	BCL10	O95999	233 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	DGKA	P23743	735 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB17	Q13105	803 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ALCAM	Q13740	583 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SNAPC1	Q16533	368 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CRY2	Q49AN0	593 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CBWD6	Q4V339	395 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KRT80	Q6KB66	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	POC1A	Q8NBT0	407 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF653	Q96CK0	615 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LMLN	Q96KR4	655 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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