RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 D2HGDHQ8N465 521 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 CD180Q99467 661 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 RAD18Q9NS91 495 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 KCND1Q9NSA2 647 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 CD48P09326 243 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 PIRTP0C851 137 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 CCNCP24863 283 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 RIPPLY3P57055 190 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 KYNUQ16719 465 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM11Q96F44 468 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 RANBP9Q96S59 729 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 NLNQ9BYT8 704 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRA-208ENST00000455631 F5H423 210 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MEN1O00255 615 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MMP2P08253 660 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 GZMAP12544 262 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ATP1A4Q13733 1029 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 GTF2H3Q13889 308 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ASIC2Q16515 512 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 DSELQ8IZU8 1212 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 SLC34A3Q8N130 599 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 OR8K5Q8NH50 307 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 CPT1BQ92523 772 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 FATE1Q969F0 183 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MOCOSQ96EN8 888 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 LRFN5Q96NI6 719 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 OR5K3A6NET4 321 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MYBL1P10243 752 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ZBTB2Q8N680 514 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MARVELD3Q96A59 401 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 CLIP3Q96DZ5 547 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 SGSM3Q96HU1 749 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TSGA13Q96PP4 275 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 C5AR2Q9P296 337 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF711Q9Y462 761 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PCSK5Q92824 1860 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 LRRC53A6NM62 1247 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 RPE65Q16518 533 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 FAM198BQ6UWH4 519 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 OOSP2Q86WS3 158 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 GDAP1Q8TB36 358 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 BTBD6Q96KE9 485 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MYO6Q9UM54 1294 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.226e-26■■■■■ 54.6
PTPRA-208ENST00000455631 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 BPIP17213 487 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TLR10Q9BXR5 811 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 FANCEQ9HB96 536 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 PRF1P14222 555 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 RORAP35398 523 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 GJC1P36383 396 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ABRQ12979 859 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 DPYSL3Q14195 570 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 ARMC6Q6NXE6 501 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 AMZ2Q86W34 360 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 RAB43Q86YS6 212 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 CCNYQ8ND76 341 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TTC25Q96NG3 672 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 VPS35Q96QK1 796 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRA-208ENST00000455631 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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