RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM168Q9H0V1 697 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR34Q9UPC5 381 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFHX4Q86UP3 3567 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LMO7DNF2Z398 122 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TPP1O14773 563 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PFDN6O15212 129 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ANXA6P08133 673 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ALPPL2P10696 532 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ARNTP27540 789 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GRK6P43250 576 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TTPAP49638 278 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf61Q13536 156 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 NEPROQ6NW34 567 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SLCO6A1Q86UG4 719 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 IGDCC3Q8IVU1 814 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT20Q8IY31 132 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR150Q8NGU9 434 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TCF12Q99081 682 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP23Q9BVJ7 150 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CLPBQ9H078 707 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 NLGN3Q9NZ94 848 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 F8W8V4 182 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNJ13O60928 360 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DKK1O94907 266 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 AP2A2O94973 939 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RHOXF2BP0C7M4 288 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS56P0CW18 603 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 NSG1P42857 185 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CUL1Q13616 776 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYMQ14894 314 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 STEAP4Q687X5 459 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PACS1Q6VY07 963 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBED8Q8IZ13 594 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CALML6Q8TD86 181 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PYROXD1Q8WU10 500 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT81Q8WYA0 676 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP36Q96G28 342 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 QSOX1O00391 747 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 YY2O15391 372 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OGNP20774 298 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCNKAP51800 687 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 B4GALNT1Q00973 533 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CTBSQ01459 385 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP9Q49MG5 647 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 BCL7AQ4VC05 210 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 MICALCLQ6ZW33 695 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PROSER1Q86XN7 944 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PNPLA1Q8N8W4 532 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4C6Q8NH72 309 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SGF29Q96ES7 293 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM29Q9BSF4 260 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPRBP23467 1997 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LRP4O75096 1905 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL33A6NCF5 533 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TAF4O00268 1085 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FFAR2O15552 330 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms