RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IPO13O94829 963 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSD17B1P14061 328 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEBPBP17676 345 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL10P22301 178 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADRA1AP35348 466 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RELAQ04206 551 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTBP1Q13363 440 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PMS2P3Q13401 168 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TGFBIQ15582 683 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCSK7Q16549 785 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LCN8Q6JVE9 175 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LAYNQ6UX15 382 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMC5Q6UXY8 1006 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF783Q6ZMS7 281 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ELMO2Q96JJ3 720 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZSWIM3Q96MP5 696 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NEMP2A6NFY4 417 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SOBPA7XYQ1 873 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF197O14709 1029 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RASAL1O95294 804 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MMP2P08253 660 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARSAP15289 507 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FASP25445 335 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARNTP27540 789 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CD151P48509 253 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WNT3AP56704 352 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BNIP2Q12982 314 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAB39AQ14964 217 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYLKQ15746 1914 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MOGQ16653 247 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MPPE1Q53F39 396 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KDELC1Q6UW63 502 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCDC5Q6ZRR9 648 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KDELC2Q7Z4H8 507 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FUNDC1Q8IVP5 155 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VN1R2Q8NFZ6 395 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARRDC2Q8TBH0 407 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM110BQ8TC76 370 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TUBA1CQ9BQE3 449 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FIS1Q9Y3D6 152 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A8MT66 165 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RFXAPO00287 272 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GJB3O75712 270 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSKP41240 450 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCT8P50990 548 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C21orf59P57076 290 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IHHQ14623 411 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM83EQ2M2I3 478 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATS1Q496A3 300 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DENND5AQ6IQ26 1287 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ITFG1Q8TB96 612 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEMA3CQ99985 751 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FEM1AQ9BSK4 669 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRMOQ9BU70 441 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEPT3Q9UH03 358 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COQ6Q9Y2Z9 468 aa17.04■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC78A2IDD5 438 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NME4O00746 187 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACOX3O15254 700 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNAP91O60641 907 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SERPINB7O75635 380 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPX3P22352 226 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARF5P84085 180 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MPP7Q5T2T1 576 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMTC4Q5T4D3 741 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RETREG3Q86VR2 466 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MINDY1Q8N5J2 469 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACTR3BQ9P1U1 418 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFAF1Q9Y375 327 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAF6Q9Y4K3 522 aa17.03■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FUOMA2VDF0 154 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBP1P09455 135 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNA5P22460 613 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC1A2P43004 574 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STX1BP61266 288 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNC3Q14003 757 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AGAP9Q5VTM2 703 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPR107Q5VW38 600 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RANBP10Q6VN20 620 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYHR1Q6ZMK1 362 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC22A9Q8IVM8 553 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR9I1Q8NGQ6 314 aa17.02■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PSKH2Q96QS6 385 aa17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms