RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 BRD3Q15059 726 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 POSTNQ15063 836 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 WLSQ5T9L3 541 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 C1orf228Q6PIY5 440 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 RRM2BQ7LG56 351 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF383Q8NA42 475 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 C17orf47Q8NEP4 570 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 SUSD6Q92537 303 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 SEMA4DQ92854 862 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 IGSF8Q969P0 613 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 KRT12Q99456 494 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 REEP2Q9BRK0 252 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 WWTR1Q9GZV5 400 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 THEGQ9P2T0 379 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 YIPF1Q9Y548 306 aa2.97□□□□□ -1.93
USP9YP28-201ENST00000435142 OR6C76A6NM76 312 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 CTSCP53634 463 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 PRKG1Q13976 671 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 E2F5Q15329 346 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 HACE1Q8IYU2 909 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 DCLK2Q8N568 766 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 VPS37AQ8NEZ2 397 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 HARBI1Q96MB7 349 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 USP28Q96RU2 1077 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 FUCA2Q9BTY2 467 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SIL1Q9H173 461 aa2.96□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 IDH3BO43837 385 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 C22orf31O95567 290 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 CDAP32320 146 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 CDH11P55287 796 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 MFAP5Q13361 173 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC5A8Q8N695 610 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SEMA3CQ99985 751 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF700Q9H0M5 742 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.95□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM129A0AVI4 362 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE10A6NGK3 116 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 F5H423 210 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 HTR3AP46098 478 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 THOP1P52888 689 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 FGFBP1Q14512 234 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC22A25Q6T423 547 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 DNAJC22Q8N4W6 341 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 KLHL15Q96M94 604 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 STK39Q9UEW8 545 aa2.94□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 DNM1LO00429 736 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 MAGEA11P43364 429 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GSCP56915 257 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GSDMDP57764 484 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 CDC16Q13042 620 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GPR17Q13304 367 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 UBE4AQ14139 1066 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM14Q14142 442 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 NFIL3Q16649 462 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 C2CD5Q86YS7 1000 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 EMC1Q8N766 993 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 POF1BQ8WVV4 589 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SMPDL3BQ92485 455 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SLCO2A1Q92959 643 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GAL3ST4Q96RP7 486 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 NYAP2Q9P242 653 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC7A7Q9UM01 511 aa2.93□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GUCY1B2O75343 617 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 COX7A2P14406 83 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 CKMT2P17540 419 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 DRD3P35462 400 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 UFM1P61960 85 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 PARP8Q8N3A8 854 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 Q8NBF4 154 aa2.92□□□□□ -1.94
USP9YP28-201ENST00000435142 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms